Berkembangnya suatu sistem, dalam hal ini sistem budidaya, tetntu mempunyai kelebihan dan kekurangan apabila dibandingkan dengan sistem yang lain. Demikian pula sistem pertanian organik mempunyai kelebihan dan kekurnagan dibandingkan dengan sistem pertanian non organik.
Kelebihan.
Kelebihan pertanian organik antara lain sebgai berikut:
- Tidak menggunakan pupuk atau pestisida kimia sehingga tidak menimbulkan pencemaran lingkungan, baik pencemaran tanah, air, amupun udara, serta produknya tidak mengandung racun.
- Tanaman organik mempunyai rasa yang lebih manis dibandingkan tanaman non-organik
- Produk tanaman organik lebih mahal.
Sistem pertanian organik juga mempunyai faktor kekuarangan atau kelemahan, yaitu sebagai berikut:
- Kebutuhan tenaga kerja lebih banyak, terutama untuk pengendalian hama dan penyakit. Umumnya, pengendalian hama dan penyakit masih dialkukan secara manual. Apabila menggunakan pestisida alami, perlu dibuat sendiri karena pestisida ini belum ada dipasaran.
- Penampilan fisik tanaman organik kurang bagus ( misalnya berukuran lebih kecil dan daun berlubang-lubang) dibandingkan dengan tanaman yang dipelihara secara non-organik.